Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR0

Rnf25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf25Q9QZR0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf25Q9QZR0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms