Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tnnt3Q9QZ47 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tnnt3Q9QZ47 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tnnt3Q9QZ47 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tnnt3Q9QZ47 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tnnt3Q9QZ47 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tnnt3Q9QZ47 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tnnt3Q9QZ47 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tnnt3Q9QZ47 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Tnnt3Q9QZ47 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tnnt3Q9QZ47 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Tnnt3Q9QZ47 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tnnt3Q9QZ47 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tnnt3Q9QZ47 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tnnt3Q9QZ47 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tnnt3Q9QZ47 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tnnt3Q9QZ47 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tnnt3Q9QZ47 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tnnt3Q9QZ47 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Tnnt3Q9QZ47 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tnnt3Q9QZ47 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tnnt3Q9QZ47 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tnnt3Q9QZ47 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tnnt3Q9QZ47 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tnnt3Q9QZ47 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tnnt3Q9QZ47 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tnnt3Q9QZ47 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Tnnt3Q9QZ47 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tnnt3Q9QZ47 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tnnt3Q9QZ47 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tnnt3Q9QZ47 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tnnt3Q9QZ47 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tnnt3Q9QZ47 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tnnt3Q9QZ47 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tnnt3Q9QZ47 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tnnt3Q9QZ47 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tnnt3Q9QZ47 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tnnt3Q9QZ47 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tnnt3Q9QZ47 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tnnt3Q9QZ47 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tnnt3Q9QZ47 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tnnt3Q9QZ47 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tnnt3Q9QZ47 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tnnt3Q9QZ47 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tnnt3Q9QZ47 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tnnt3Q9QZ47 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tnnt3Q9QZ47 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Tnnt3Q9QZ47 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tnnt3Q9QZ47 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tnnt3Q9QZ47 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tnnt3Q9QZ47 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tnnt3Q9QZ47 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tnnt3Q9QZ47 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tnnt3Q9QZ47 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tnnt3Q9QZ47 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tnnt3Q9QZ47 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tnnt3Q9QZ47 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tnnt3Q9QZ47 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tnnt3Q9QZ47 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tnnt3Q9QZ47 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tnnt3Q9QZ47 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms