Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phtf1Q9QZ09 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Phtf1Q9QZ09 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 675.1 ms