Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR6

Map1a, Microtubule-associated protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 2,776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1aQ9QYR6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Map1aQ9QYR6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Map1aQ9QYR6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Map1aQ9QYR6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Map1aQ9QYR6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Map1aQ9QYR6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Map1aQ9QYR6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Map1aQ9QYR6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Map1aQ9QYR6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Map1aQ9QYR6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Map1aQ9QYR6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Map1aQ9QYR6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Map1aQ9QYR6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Map1aQ9QYR6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Map1aQ9QYR6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Map1aQ9QYR6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Map1aQ9QYR6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Map1aQ9QYR6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Map1aQ9QYR6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Map1aQ9QYR6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Map1aQ9QYR6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Map1aQ9QYR6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Map1aQ9QYR6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Map1aQ9QYR6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Map1aQ9QYR6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms