Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Homer2Q9QWW1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Homer2Q9QWW1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Homer2Q9QWW1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Homer2Q9QWW1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Homer2Q9QWW1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Homer2Q9QWW1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Homer2Q9QWW1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Homer2Q9QWW1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Homer2Q9QWW1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Homer2Q9QWW1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Homer2Q9QWW1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Homer2Q9QWW1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Homer2Q9QWW1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Homer2Q9QWW1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Homer2Q9QWW1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Homer2Q9QWW1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Homer2Q9QWW1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Homer2Q9QWW1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Homer2Q9QWW1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Homer2Q9QWW1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Homer2Q9QWW1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Homer2Q9QWW1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Homer2Q9QWW1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Homer2Q9QWW1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms