Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msh5Q9QUM7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Msh5Q9QUM7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Msh5Q9QUM7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Msh5Q9QUM7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Msh5Q9QUM7 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Msh5Q9QUM7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Msh5Q9QUM7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Msh5Q9QUM7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Msh5Q9QUM7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Msh5Q9QUM7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Msh5Q9QUM7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Msh5Q9QUM7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Msh5Q9QUM7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Msh5Q9QUM7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Msh5Q9QUM7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Msh5Q9QUM7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Msh5Q9QUM7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms