Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csnk1eQ9JMK2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csnk1eQ9JMK2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csnk1eQ9JMK2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csnk1eQ9JMK2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csnk1eQ9JMK2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csnk1eQ9JMK2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csnk1eQ9JMK2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csnk1eQ9JMK2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csnk1eQ9JMK2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csnk1eQ9JMK2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csnk1eQ9JMK2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csnk1eQ9JMK2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csnk1eQ9JMK2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csnk1eQ9JMK2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csnk1eQ9JMK2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csnk1eQ9JMK2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csnk1eQ9JMK2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csnk1eQ9JMK2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Csnk1eQ9JMK2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csnk1eQ9JMK2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csnk1eQ9JMK2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csnk1eQ9JMK2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csnk1eQ9JMK2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Csnk1eQ9JMK2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Csnk1eQ9JMK2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.7 ms