Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdgfl3Q9JMG7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms