Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM93

Arl6ip4, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip4Q9JM93 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arl6ip4Q9JM93 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arl6ip4Q9JM93 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arl6ip4Q9JM93 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Arl6ip4Q9JM93 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arl6ip4Q9JM93 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arl6ip4Q9JM93 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arl6ip4Q9JM93 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arl6ip4Q9JM93 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arl6ip4Q9JM93 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arl6ip4Q9JM93 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arl6ip4Q9JM93 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arl6ip4Q9JM93 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arl6ip4Q9JM93 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Arl6ip4Q9JM93 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arl6ip4Q9JM93 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arl6ip4Q9JM93 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arl6ip4Q9JM93 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arl6ip4Q9JM93 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arl6ip4Q9JM93 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arl6ip4Q9JM93 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arl6ip4Q9JM93 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arl6ip4Q9JM93 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arl6ip4Q9JM93 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arl6ip4Q9JM93 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arl6ip4Q9JM93 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arl6ip4Q9JM93 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms