Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PnkpQ9JLV6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PnkpQ9JLV6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PnkpQ9JLV6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PnkpQ9JLV6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PnkpQ9JLV6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PnkpQ9JLV6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PnkpQ9JLV6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PnkpQ9JLV6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PnkpQ9JLV6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PnkpQ9JLV6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PnkpQ9JLV6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PnkpQ9JLV6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PnkpQ9JLV6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PnkpQ9JLV6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PnkpQ9JLV6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PnkpQ9JLV6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PnkpQ9JLV6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PnkpQ9JLV6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PnkpQ9JLV6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PnkpQ9JLV6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PnkpQ9JLV6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms