Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfx5Q9JL61 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx5Q9JL61 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx5Q9JL61 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx5Q9JL61 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx5Q9JL61 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx5Q9JL61 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx5Q9JL61 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx5Q9JL61 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx5Q9JL61 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx5Q9JL61 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx5Q9JL61 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rfx5Q9JL61 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfx5Q9JL61 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms