Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trem3Q9JKE1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms