Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pard6bQ9JK83 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pard6bQ9JK83 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.9 ms