Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msgn1Q9JK54 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msgn1Q9JK54 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Msgn1Q9JK54 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Msgn1Q9JK54 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms