Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK42

Pdk2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdk2Q9JK42 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdk2Q9JK42 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdk2Q9JK42 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdk2Q9JK42 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdk2Q9JK42 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdk2Q9JK42 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdk2Q9JK42 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdk2Q9JK42 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdk2Q9JK42 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdk2Q9JK42 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdk2Q9JK42 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdk2Q9JK42 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdk2Q9JK42 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdk2Q9JK42 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdk2Q9JK42 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdk2Q9JK42 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdk2Q9JK42 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdk2Q9JK42 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdk2Q9JK42 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdk2Q9JK42 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdk2Q9JK42 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdk2Q9JK42 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdk2Q9JK42 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdk2Q9JK42 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdk2Q9JK42 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdk2Q9JK42 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdk2Q9JK42 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdk2Q9JK42 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdk2Q9JK42 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdk2Q9JK42 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms