Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJQ0

Pigb, GPI mannosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigbQ9JJQ0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PigbQ9JJQ0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PigbQ9JJQ0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PigbQ9JJQ0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PigbQ9JJQ0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PigbQ9JJQ0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PigbQ9JJQ0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PigbQ9JJQ0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PigbQ9JJQ0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PigbQ9JJQ0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PigbQ9JJQ0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PigbQ9JJQ0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PigbQ9JJQ0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PigbQ9JJQ0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PigbQ9JJQ0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PigbQ9JJQ0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PigbQ9JJQ0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PigbQ9JJQ0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PigbQ9JJQ0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PigbQ9JJQ0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PigbQ9JJQ0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PigbQ9JJQ0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PigbQ9JJQ0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PigbQ9JJQ0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PigbQ9JJQ0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PigbQ9JJQ0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PigbQ9JJQ0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PigbQ9JJQ0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PigbQ9JJQ0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PigbQ9JJQ0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PigbQ9JJQ0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PigbQ9JJQ0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PigbQ9JJQ0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PigbQ9JJQ0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PigbQ9JJQ0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PigbQ9JJQ0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PigbQ9JJQ0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PigbQ9JJQ0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PigbQ9JJQ0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PigbQ9JJQ0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PigbQ9JJQ0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PigbQ9JJQ0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PigbQ9JJQ0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PigbQ9JJQ0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PigbQ9JJQ0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PigbQ9JJQ0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PigbQ9JJQ0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PigbQ9JJQ0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PigbQ9JJQ0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PigbQ9JJQ0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PigbQ9JJQ0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PigbQ9JJQ0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PigbQ9JJQ0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PigbQ9JJQ0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PigbQ9JJQ0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PigbQ9JJQ0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PigbQ9JJQ0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PigbQ9JJQ0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PigbQ9JJQ0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PigbQ9JJQ0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PigbQ9JJQ0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PigbQ9JJQ0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PigbQ9JJQ0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PigbQ9JJQ0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PigbQ9JJQ0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PigbQ9JJQ0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PigbQ9JJQ0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PigbQ9JJQ0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PigbQ9JJQ0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PigbQ9JJQ0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PigbQ9JJQ0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PigbQ9JJQ0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PigbQ9JJQ0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PigbQ9JJQ0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PigbQ9JJQ0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PigbQ9JJQ0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PigbQ9JJQ0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PigbQ9JJQ0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PigbQ9JJQ0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PigbQ9JJQ0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PigbQ9JJQ0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PigbQ9JJQ0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PigbQ9JJQ0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PigbQ9JJQ0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PigbQ9JJQ0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PigbQ9JJQ0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PigbQ9JJQ0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PigbQ9JJQ0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PigbQ9JJQ0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PigbQ9JJQ0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PigbQ9JJQ0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PigbQ9JJQ0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PigbQ9JJQ0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PigbQ9JJQ0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PigbQ9JJQ0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PigbQ9JJQ0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PigbQ9JJQ0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PigbQ9JJQ0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PigbQ9JJQ0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PigbQ9JJQ0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms