Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Riox1Q9JJF3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Riox1Q9JJF3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms