Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc86Q9JJ89 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc86Q9JJ89 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc86Q9JJ89 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc86Q9JJ89 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc86Q9JJ89 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc86Q9JJ89 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc86Q9JJ89 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc86Q9JJ89 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc86Q9JJ89 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc86Q9JJ89 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms