Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2ird1Q9JI57 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2ird1Q9JI57 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms