Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rapgef4Q9EQZ6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rapgef4Q9EQZ6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rapgef4Q9EQZ6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rapgef4Q9EQZ6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rapgef4Q9EQZ6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rapgef4Q9EQZ6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rapgef4Q9EQZ6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rapgef4Q9EQZ6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rapgef4Q9EQZ6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rapgef4Q9EQZ6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rapgef4Q9EQZ6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rapgef4Q9EQZ6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rapgef4Q9EQZ6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rapgef4Q9EQZ6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rapgef4Q9EQZ6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rapgef4Q9EQZ6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rapgef4Q9EQZ6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rapgef4Q9EQZ6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rapgef4Q9EQZ6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rapgef4Q9EQZ6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rapgef4Q9EQZ6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rapgef4Q9EQZ6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Rapgef4Q9EQZ6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rapgef4Q9EQZ6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rapgef4Q9EQZ6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Rapgef4Q9EQZ6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Rapgef4Q9EQZ6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rapgef4Q9EQZ6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rapgef4Q9EQZ6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rapgef4Q9EQZ6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rapgef4Q9EQZ6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rapgef4Q9EQZ6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rapgef4Q9EQZ6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rapgef4Q9EQZ6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rapgef4Q9EQZ6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rapgef4Q9EQZ6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rapgef4Q9EQZ6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rapgef4Q9EQZ6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rapgef4Q9EQZ6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms