Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col4a3bpQ9EQG9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms