Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP97

Senp3, Sentrin-specific protease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp3Q9EP97 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Senp3Q9EP97 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Senp3Q9EP97 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Senp3Q9EP97 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Senp3Q9EP97 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Senp3Q9EP97 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Senp3Q9EP97 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Senp3Q9EP97 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Senp3Q9EP97 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Senp3Q9EP97 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Senp3Q9EP97 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Senp3Q9EP97 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Senp3Q9EP97 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Senp3Q9EP97 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Senp3Q9EP97 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Senp3Q9EP97 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Senp3Q9EP97 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Senp3Q9EP97 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Senp3Q9EP97 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Senp3Q9EP97 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Senp3Q9EP97 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Senp3Q9EP97 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Senp3Q9EP97 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Senp3Q9EP97 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Senp3Q9EP97 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Senp3Q9EP97 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Senp3Q9EP97 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Senp3Q9EP97 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Senp3Q9EP97 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Senp3Q9EP97 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Senp3Q9EP97 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Senp3Q9EP97 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Senp3Q9EP97 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Senp3Q9EP97 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Senp3Q9EP97 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Senp3Q9EP97 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Senp3Q9EP97 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Senp3Q9EP97 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Senp3Q9EP97 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Senp3Q9EP97 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Senp3Q9EP97 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Senp3Q9EP97 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Senp3Q9EP97 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Senp3Q9EP97 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Senp3Q9EP97 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Senp3Q9EP97 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Senp3Q9EP97 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Senp3Q9EP97 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Senp3Q9EP97 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Senp3Q9EP97 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Senp3Q9EP97 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Senp3Q9EP97 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Senp3Q9EP97 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms