Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCV7

Krt7, Keratin, type II cytoskeletal 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt7Q9DCV7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt7Q9DCV7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt7Q9DCV7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt7Q9DCV7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt7Q9DCV7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt7Q9DCV7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt7Q9DCV7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt7Q9DCV7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt7Q9DCV7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt7Q9DCV7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt7Q9DCV7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt7Q9DCV7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt7Q9DCV7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt7Q9DCV7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt7Q9DCV7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt7Q9DCV7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt7Q9DCV7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Krt7Q9DCV7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt7Q9DCV7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt7Q9DCV7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt7Q9DCV7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt7Q9DCV7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt7Q9DCV7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt7Q9DCV7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt7Q9DCV7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt7Q9DCV7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt7Q9DCV7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt7Q9DCV7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt7Q9DCV7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt7Q9DCV7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt7Q9DCV7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt7Q9DCV7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt7Q9DCV7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt7Q9DCV7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt7Q9DCV7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt7Q9DCV7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt7Q9DCV7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt7Q9DCV7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt7Q9DCV7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt7Q9DCV7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt7Q9DCV7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt7Q9DCV7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt7Q9DCV7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt7Q9DCV7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt7Q9DCV7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt7Q9DCV7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt7Q9DCV7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms