Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl4Q9DCU6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl4Q9DCU6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl4Q9DCU6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl4Q9DCU6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl4Q9DCU6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl4Q9DCU6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl4Q9DCU6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl4Q9DCU6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl4Q9DCU6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl4Q9DCU6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl4Q9DCU6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl4Q9DCU6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl4Q9DCU6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl4Q9DCU6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl4Q9DCU6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl4Q9DCU6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl4Q9DCU6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl4Q9DCU6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl4Q9DCU6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl4Q9DCU6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl4Q9DCU6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl4Q9DCU6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl4Q9DCU6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl4Q9DCU6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms