Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smg9Q9DB90 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg9Q9DB90 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg9Q9DB90 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg9Q9DB90 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg9Q9DB90 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg9Q9DB90 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg9Q9DB90 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg9Q9DB90 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg9Q9DB90 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg9Q9DB90 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smg9Q9DB90 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smg9Q9DB90 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smg9Q9DB90 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smg9Q9DB90 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smg9Q9DB90 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smg9Q9DB90 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smg9Q9DB90 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smg9Q9DB90 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smg9Q9DB90 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smg9Q9DB90 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smg9Q9DB90 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg9Q9DB90 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg9Q9DB90 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg9Q9DB90 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms