Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp2aQ9DB34 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp2aQ9DB34 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms