Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Speer4bQ9D9F7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Speer4bQ9D9F7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Speer4bQ9D9F7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Speer4bQ9D9F7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Speer4bQ9D9F7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Speer4bQ9D9F7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Speer4bQ9D9F7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Speer4bQ9D9F7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Speer4bQ9D9F7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Speer4bQ9D9F7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Speer4bQ9D9F7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Speer4bQ9D9F7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Speer4bQ9D9F7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Speer4bQ9D9F7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Speer4bQ9D9F7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Speer4bQ9D9F7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Speer4bQ9D9F7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Speer4bQ9D9F7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Speer4bQ9D9F7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Speer4bQ9D9F7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Speer4bQ9D9F7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Speer4bQ9D9F7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Speer4bQ9D9F7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Speer4bQ9D9F7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Speer4bQ9D9F7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Speer4bQ9D9F7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Speer4bQ9D9F7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Speer4bQ9D9F7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Speer4bQ9D9F7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Speer4bQ9D9F7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Speer4bQ9D9F7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Speer4bQ9D9F7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Speer4bQ9D9F7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Speer4bQ9D9F7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Speer4bQ9D9F7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Speer4bQ9D9F7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Speer4bQ9D9F7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Speer4bQ9D9F7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Speer4bQ9D9F7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Speer4bQ9D9F7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Speer4bQ9D9F7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Speer4bQ9D9F7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Speer4bQ9D9F7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Speer4bQ9D9F7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Speer4bQ9D9F7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Speer4bQ9D9F7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Speer4bQ9D9F7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms