Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2e2Q9D902 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gtf2e2Q9D902 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e2Q9D902 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms