Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y7

Tnfaip8l2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfaip8l2Q9D8Y7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfaip8l2Q9D8Y7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfaip8l2Q9D8Y7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfaip8l2Q9D8Y7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfaip8l2Q9D8Y7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfaip8l2Q9D8Y7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms