Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chmp4bQ9D8B3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chmp4bQ9D8B3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chmp4bQ9D8B3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chmp4bQ9D8B3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Chmp4bQ9D8B3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chmp4bQ9D8B3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chmp4bQ9D8B3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Chmp4bQ9D8B3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chmp4bQ9D8B3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chmp4bQ9D8B3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chmp4bQ9D8B3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chmp4bQ9D8B3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chmp4bQ9D8B3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chmp4bQ9D8B3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chmp4bQ9D8B3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chmp4bQ9D8B3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chmp4bQ9D8B3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chmp4bQ9D8B3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chmp4bQ9D8B3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chmp4bQ9D8B3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chmp4bQ9D8B3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chmp4bQ9D8B3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Chmp4bQ9D8B3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms