Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Borcs6Q9D6W8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Borcs6Q9D6W8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Borcs6Q9D6W8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Borcs6Q9D6W8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Borcs6Q9D6W8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Borcs6Q9D6W8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Borcs6Q9D6W8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Borcs6Q9D6W8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Borcs6Q9D6W8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Borcs6Q9D6W8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Borcs6Q9D6W8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Borcs6Q9D6W8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Borcs6Q9D6W8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Borcs6Q9D6W8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Borcs6Q9D6W8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Borcs6Q9D6W8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Borcs6Q9D6W8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Borcs6Q9D6W8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Borcs6Q9D6W8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Borcs6Q9D6W8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Borcs6Q9D6W8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Borcs6Q9D6W8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Borcs6Q9D6W8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Borcs6Q9D6W8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Borcs6Q9D6W8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Borcs6Q9D6W8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Borcs6Q9D6W8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Borcs6Q9D6W8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Borcs6Q9D6W8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Borcs6Q9D6W8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Borcs6Q9D6W8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Borcs6Q9D6W8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Borcs6Q9D6W8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Borcs6Q9D6W8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Borcs6Q9D6W8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Borcs6Q9D6W8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms