Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6P8

Calml3, Calmodulin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calml3Q9D6P8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Calml3Q9D6P8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Calml3Q9D6P8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Calml3Q9D6P8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Calml3Q9D6P8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Calml3Q9D6P8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Calml3Q9D6P8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Calml3Q9D6P8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Calml3Q9D6P8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Calml3Q9D6P8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Calml3Q9D6P8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Calml3Q9D6P8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Calml3Q9D6P8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Calml3Q9D6P8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Calml3Q9D6P8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Calml3Q9D6P8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Calml3Q9D6P8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Calml3Q9D6P8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Calml3Q9D6P8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Calml3Q9D6P8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Calml3Q9D6P8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Calml3Q9D6P8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Calml3Q9D6P8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Calml3Q9D6P8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms