Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sf3a3Q9D554 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sf3a3Q9D554 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms