Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PrameQ9D4Z5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PrameQ9D4Z5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrameQ9D4Z5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrameQ9D4Z5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrameQ9D4Z5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrameQ9D4Z5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrameQ9D4Z5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrameQ9D4Z5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrameQ9D4Z5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrameQ9D4Z5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrameQ9D4Z5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrameQ9D4Z5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrameQ9D4Z5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrameQ9D4Z5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrameQ9D4Z5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrameQ9D4Z5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrameQ9D4Z5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrameQ9D4Z5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrameQ9D4Z5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrameQ9D4Z5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrameQ9D4Z5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrameQ9D4Z5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrameQ9D4Z5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrameQ9D4Z5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrameQ9D4Z5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrameQ9D4Z5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrameQ9D4Z5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrameQ9D4Z5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrameQ9D4Z5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrameQ9D4Z5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms