Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2al3Q9D4U4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms