Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rasgef1cQ9D300 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rasgef1cQ9D300 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rasgef1cQ9D300 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rasgef1cQ9D300 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rasgef1cQ9D300 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rasgef1cQ9D300 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rasgef1cQ9D300 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rasgef1cQ9D300 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rasgef1cQ9D300 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rasgef1cQ9D300 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rasgef1cQ9D300 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rasgef1cQ9D300 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rasgef1cQ9D300 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rasgef1cQ9D300 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rasgef1cQ9D300 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rasgef1cQ9D300 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rasgef1cQ9D300 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rasgef1cQ9D300 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rasgef1cQ9D300 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rasgef1cQ9D300 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rasgef1cQ9D300 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rasgef1cQ9D300 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rasgef1cQ9D300 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rasgef1cQ9D300 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rasgef1cQ9D300 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rasgef1cQ9D300 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rasgef1cQ9D300 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rasgef1cQ9D300 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms