Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Klhdc8bQ9D2D9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhdc8bQ9D2D9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Klhdc8bQ9D2D9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Klhdc8bQ9D2D9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Klhdc8bQ9D2D9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Klhdc8bQ9D2D9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Klhdc8bQ9D2D9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Klhdc8bQ9D2D9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhdc8bQ9D2D9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhdc8bQ9D2D9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhdc8bQ9D2D9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhdc8bQ9D2D9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhdc8bQ9D2D9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhdc8bQ9D2D9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhdc8bQ9D2D9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhdc8bQ9D2D9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhdc8bQ9D2D9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhdc8bQ9D2D9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhdc8bQ9D2D9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhdc8bQ9D2D9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhdc8bQ9D2D9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhdc8bQ9D2D9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Klhdc8bQ9D2D9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhdc8bQ9D2D9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhdc8bQ9D2D9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhdc8bQ9D2D9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Klhdc8bQ9D2D9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Klhdc8bQ9D2D9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhdc8bQ9D2D9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klhdc8bQ9D2D9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klhdc8bQ9D2D9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klhdc8bQ9D2D9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhdc8bQ9D2D9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms