Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E6

Tbcb, Tubulin-folding cofactor B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcbQ9D1E6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TbcbQ9D1E6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TbcbQ9D1E6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TbcbQ9D1E6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TbcbQ9D1E6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TbcbQ9D1E6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TbcbQ9D1E6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TbcbQ9D1E6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TbcbQ9D1E6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TbcbQ9D1E6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TbcbQ9D1E6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TbcbQ9D1E6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TbcbQ9D1E6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TbcbQ9D1E6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TbcbQ9D1E6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TbcbQ9D1E6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TbcbQ9D1E6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TbcbQ9D1E6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TbcbQ9D1E6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TbcbQ9D1E6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TbcbQ9D1E6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TbcbQ9D1E6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TbcbQ9D1E6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TbcbQ9D1E6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TbcbQ9D1E6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TbcbQ9D1E6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TbcbQ9D1E6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TbcbQ9D1E6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TbcbQ9D1E6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TbcbQ9D1E6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TbcbQ9D1E6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TbcbQ9D1E6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TbcbQ9D1E6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TbcbQ9D1E6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TbcbQ9D1E6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TbcbQ9D1E6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TbcbQ9D1E6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 361.8 ms