Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl28Q9D1B9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mrpl28Q9D1B9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms