Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem88Q9D0N8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem88Q9D0N8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms