Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc47Q9D024 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc47Q9D024 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc47Q9D024 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc47Q9D024 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc47Q9D024 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc47Q9D024 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc47Q9D024 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc47Q9D024 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc47Q9D024 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc47Q9D024 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc47Q9D024 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc47Q9D024 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc47Q9D024 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc47Q9D024 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc47Q9D024 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc47Q9D024 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc47Q9D024 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc47Q9D024 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc47Q9D024 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc47Q9D024 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc47Q9D024 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc47Q9D024 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc47Q9D024 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc47Q9D024 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc47Q9D024 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc47Q9D024 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc47Q9D024 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc47Q9D024 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc47Q9D024 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc47Q9D024 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc47Q9D024 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc47Q9D024 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc47Q9D024 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc47Q9D024 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc47Q9D024 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc47Q9D024 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc47Q9D024 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc47Q9D024 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc47Q9D024 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc47Q9D024 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc47Q9D024 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc47Q9D024 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc47Q9D024 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc47Q9D024 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc47Q9D024 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc47Q9D024 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc47Q9D024 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc47Q9D024 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc47Q9D024 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc47Q9D024 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc47Q9D024 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc47Q9D024 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc47Q9D024 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc47Q9D024 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc47Q9D024 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms