Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nsfl1cQ9CZ44 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nsfl1cQ9CZ44 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nsfl1cQ9CZ44 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nsfl1cQ9CZ44 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nsfl1cQ9CZ44 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nsfl1cQ9CZ44 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nsfl1cQ9CZ44 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nsfl1cQ9CZ44 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nsfl1cQ9CZ44 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nsfl1cQ9CZ44 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nsfl1cQ9CZ44 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nsfl1cQ9CZ44 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nsfl1cQ9CZ44 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nsfl1cQ9CZ44 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nsfl1cQ9CZ44 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nsfl1cQ9CZ44 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nsfl1cQ9CZ44 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nsfl1cQ9CZ44 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nsfl1cQ9CZ44 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nsfl1cQ9CZ44 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nsfl1cQ9CZ44 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nsfl1cQ9CZ44 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nsfl1cQ9CZ44 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nsfl1cQ9CZ44 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Nsfl1cQ9CZ44 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nsfl1cQ9CZ44 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nsfl1cQ9CZ44 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nsfl1cQ9CZ44 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nsfl1cQ9CZ44 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nsfl1cQ9CZ44 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nsfl1cQ9CZ44 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nsfl1cQ9CZ44 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Nsfl1cQ9CZ44 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nsfl1cQ9CZ44 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nsfl1cQ9CZ44 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nsfl1cQ9CZ44 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nsfl1cQ9CZ44 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nsfl1cQ9CZ44 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nsfl1cQ9CZ44 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nsfl1cQ9CZ44 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nsfl1cQ9CZ44 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nsfl1cQ9CZ44 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nsfl1cQ9CZ44 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nsfl1cQ9CZ44 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nsfl1cQ9CZ44 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nsfl1cQ9CZ44 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nsfl1cQ9CZ44 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nsfl1cQ9CZ44 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nsfl1cQ9CZ44 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nsfl1cQ9CZ44 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nsfl1cQ9CZ44 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms