Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Nip7Q9CXK8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nip7Q9CXK8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nip7Q9CXK8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms