Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd12Q9CWU0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd12Q9CWU0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tdrd12Q9CWU0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tdrd12Q9CWU0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tdrd12Q9CWU0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdrd12Q9CWU0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms