Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Snx10Q9CWT3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snx10Q9CWT3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snx10Q9CWT3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms