Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Sycp2Q9CUU3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC41.44■■■■■ 4.23
Sycp2Q9CUU3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Sycp2Q9CUU3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Sycp2Q9CUU3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Sycp2Q9CUU3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Sycp2Q9CUU3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Sycp2Q9CUU3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Sycp2Q9CUU3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Sycp2Q9CUU3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Sycp2Q9CUU3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Sycp2Q9CUU3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
Sycp2Q9CUU3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Sycp2Q9CUU3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Sycp2Q9CUU3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
Sycp2Q9CUU3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Sycp2Q9CUU3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Sycp2Q9CUU3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Sycp2Q9CUU3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
Sycp2Q9CUU3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Sycp2Q9CUU3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
Sycp2Q9CUU3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Sycp2Q9CUU3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Sycp2Q9CUU3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Sycp2Q9CUU3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Sycp2Q9CUU3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Sycp2Q9CUU3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
Sycp2Q9CUU3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Sycp2Q9CUU3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Sycp2Q9CUU3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
Sycp2Q9CUU3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
Sycp2Q9CUU3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC41.34■■■■■ 4.21
Sycp2Q9CUU3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Sycp2Q9CUU3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Sycp2Q9CUU3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
Sycp2Q9CUU3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
Sycp2Q9CUU3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
Sycp2Q9CUU3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Sycp2Q9CUU3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
Sycp2Q9CUU3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Sycp2Q9CUU3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Sycp2Q9CUU3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC41.3■■■■■ 4.2
Sycp2Q9CUU3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Sycp2Q9CUU3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
Sycp2Q9CUU3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Sycp2Q9CUU3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
Sycp2Q9CUU3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Sycp2Q9CUU3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Sycp2Q9CUU3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Sycp2Q9CUU3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Sycp2Q9CUU3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.26■■■■■ 4.2
Sycp2Q9CUU3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Sycp2Q9CUU3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Sycp2Q9CUU3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Sycp2Q9CUU3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
Sycp2Q9CUU3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Sycp2Q9CUU3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Sycp2Q9CUU3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC41.23■■■■■ 4.19
Sycp2Q9CUU3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Sycp2Q9CUU3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
Sycp2Q9CUU3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
Sycp2Q9CUU3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
Sycp2Q9CUU3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Sycp2Q9CUU3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Sycp2Q9CUU3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Sycp2Q9CUU3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Sycp2Q9CUU3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
Sycp2Q9CUU3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Sycp2Q9CUU3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Sycp2Q9CUU3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Sycp2Q9CUU3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
Sycp2Q9CUU3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Sycp2Q9CUU3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Sycp2Q9CUU3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC41.16■■■■■ 4.18
Sycp2Q9CUU3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
Sycp2Q9CUU3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Sycp2Q9CUU3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Sycp2Q9CUU3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Sycp2Q9CUU3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Sycp2Q9CUU3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Sycp2Q9CUU3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Sycp2Q9CUU3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Sycp2Q9CUU3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Sycp2Q9CUU3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.18
Sycp2Q9CUU3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC41.13■■■■■ 4.17
Sycp2Q9CUU3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
Sycp2Q9CUU3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Sycp2Q9CUU3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Sycp2Q9CUU3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Sycp2Q9CUU3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC41.12■■■■■ 4.17
Sycp2Q9CUU3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Sycp2Q9CUU3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Sycp2Q9CUU3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
Sycp2Q9CUU3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
Sycp2Q9CUU3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Sycp2Q9CUU3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Sycp2Q9CUU3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Sycp2Q9CUU3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Sycp2Q9CUU3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
Sycp2Q9CUU3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC41.08■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms