Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rprd1bQ9CSU0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms