Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR63

Cox16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox16Q9CR63 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cox16Q9CR63 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cox16Q9CR63 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cox16Q9CR63 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cox16Q9CR63 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cox16Q9CR63 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cox16Q9CR63 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cox16Q9CR63 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cox16Q9CR63 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cox16Q9CR63 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cox16Q9CR63 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cox16Q9CR63 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cox16Q9CR63 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cox16Q9CR63 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cox16Q9CR63 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cox16Q9CR63 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cox16Q9CR63 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cox16Q9CR63 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cox16Q9CR63 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cox16Q9CR63 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cox16Q9CR63 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cox16Q9CR63 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cox16Q9CR63 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms