Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr3kQ9CQZ7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Polr3kQ9CQZ7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr3kQ9CQZ7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr3kQ9CQZ7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr3kQ9CQZ7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr3kQ9CQZ7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr3kQ9CQZ7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr3kQ9CQZ7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr3kQ9CQZ7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr3kQ9CQZ7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr3kQ9CQZ7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr3kQ9CQZ7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr3kQ9CQZ7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr3kQ9CQZ7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr3kQ9CQZ7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr3kQ9CQZ7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr3kQ9CQZ7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr3kQ9CQZ7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms