Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl35Q9CQL6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl35Q9CQL6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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